Details for gene set MACROMOLECULAR_COMPLEX

Table: GSEA Results Summary

Dataset	RNR_GSEA_DESEQ2_FC
Phenotype	NoPhenotypeAvailable
Upregulated in class	na_pos
GeneSet	MACROMOLECULAR_COMPLEX_ASSEMBLY
Enrichment Score (ES)	0.13216344
Normalized Enrichment Score (NES)	2.564962
Nominal p-value	0.0
FDR q-value	0.0038848165
FWER p-Value	0.037

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	CLDN14	393	1.025	-0.0178	Yes
2	GJA5	505	0.892	-0.0202	Yes
3	THEG	745	0.642	-0.0295	Yes
4	APOA4	871	0.580	-0.0327	Yes
5	FMOD	1009	0.513	-0.0365	Yes
6	ANLN	1230	0.430	-0.0448	Yes
7	KIFAP3	1244	0.425	-0.0419	Yes
8	MAPK8IP2	1284	0.409	-0.0404	Yes
9	EIF2AK3	1293	0.406	-0.0372	Yes
10	DAZ1	1440	0.359	-0.0415	Yes
11	PRLR	1504	0.348	-0.0412	Yes
12	PPARGC1A	1513	0.347	-0.0380	Yes
13	AASS	1719	0.308	-0.0455	Yes
14	SCAF11	1852	0.284	-0.0491	Yes
15	IGF1R	1982	0.263	-0.0525	Yes
16	DGKD	1985	0.263	-0.0489	Yes
17	ACTN2	2341	0.224	-0.0646	Yes
18	ATF7IP	2439	0.214	-0.0662	Yes
19	MALT1	2440	0.214	-0.0626	Yes
20	SEPT11	2570	0.204	-0.0660	Yes
21	SLC7A9	2618	0.200	-0.0649	Yes
22	IL1RAP	2665	0.196	-0.0637	Yes
23	TP63	2693	0.194	-0.0616	Yes
24	RAD51	2804	0.185	-0.0639	Yes
25	INSR	2829	0.183	-0.0616	Yes
26	VIL1	2861	0.181	-0.0596	Yes
27	MED13	2873	0.180	-0.0566	Yes
28	TGFBR1	2924	0.177	-0.0556	Yes
29	RSF1	3143	0.164	-0.0639	Yes
30	EIF1B	3375	0.152	-0.0728	Yes
31	DICER1	3427	0.149	-0.0719	Yes
32	EIF4G3	3434	0.149	-0.0686	Yes
33	GOPC	3444	0.148	-0.0654	Yes
34	SMARCA5	3476	0.147	-0.0635	Yes
35	IKBKAP	3490	0.146	-0.0605	Yes
36	TRAF1	3521	0.144	-0.0585	Yes
37	TJP1	3551	0.143	-0.0564	Yes
38	PPP2R1A	3675	0.136	-0.0595	Yes
39	EIF4B	3773	0.132	-0.0611	Yes
40	MED1	3795	0.131	-0.0586	Yes
41	CD2AP	3876	0.128	-0.0593	Yes
42	GJD3	4068	0.119	-0.0661	Yes
43	CHAF1A	4070	0.119	-0.0625	Yes
44	SRSF5	4072	0.119	-0.0589	Yes
45	MED14	4110	0.118	-0.0573	Yes
46	MED23	4197	0.115	-0.0583	Yes
47	RIMS1	4225	0.114	-0.0561	Yes
48	CD9	4239	0.113	-0.0532	Yes
49	TLN2	4289	0.112	-0.0522	Yes
50	EIF3A	4329	0.111	-0.0507	Yes
51	CCT6B	4337	0.111	-0.0474	Yes
52	APBA1	4342	0.110	-0.0440	Yes
53	GJC1	4357	0.110	-0.0411	Yes
54	PXN	4401	0.108	-0.0398	Yes
55	SEPT7	4511	0.104	-0.0421	Yes
56	EIF3E	4651	0.099	-0.0460	Yes
57	APC	4851	0.093	-0.0532	Yes
58	NOD2	4880	0.092	-0.0511	Yes
59	SCO1	4913	0.091	-0.0491	Yes
60	MDM4	4948	0.090	-0.0474	Yes
61	MED17	5034	0.088	-0.0483	Yes
62	EIF4A2	5059	0.087	-0.0460	Yes
63	EIF3F	5166	0.084	-0.0481	Yes
64	LAMC1	5188	0.083	-0.0456	Yes
65	TAF2	5203	0.083	-0.0427	Yes
66	COX15	5227	0.082	-0.0403	Yes
67	SRSF10	5245	0.082	-0.0376	Yes
68	SYK	5369	0.079	-0.0407	Yes
69	NOD1	5407	0.078	-0.0390	Yes
70	SRSF1	5422	0.078	-0.0361	Yes
71	CREBBP	5434	0.077	-0.0331	Yes
72	TLN1	5458	0.077	-0.0307	Yes
73	CRNKL1	5463	0.076	-0.0273	Yes
74	AGRN	5517	0.075	-0.0265	Yes
75	MED12	5535	0.074	-0.0238	Yes
76	THRAP3	5644	0.071	-0.0260	Yes
77	SF1	5755	0.068	-0.0283	Yes
78	COX11	5824	0.067	-0.0284	Yes
79	EIF3C	5867	0.066	-0.0270	Yes
80	WASF3	5902	0.065	-0.0252	Yes
81	EIF4G2	6188	0.058	-0.0371	Yes
82	GJA1	6322	0.055	-0.0407	Yes
83	E2F3	6326	0.055	-0.0372	Yes
84	BCL10	6352	0.054	-0.0349	Yes
85	VAMP3	6386	0.053	-0.0331	Yes
86	EIF2A	6406	0.053	-0.0305	Yes
87	EIF3H	6437	0.052	-0.0285	Yes
88	TAZ	6447	0.052	-0.0253	Yes
89	WIPF1	6450	0.051	-0.0218	Yes
90	TCEB2	6466	0.051	-0.0189	Yes
91	NPM1	6508	0.050	-0.0175	Yes
92	GJA4	6516	0.050	-0.0142	Yes
93	SLU7	6541	0.050	-0.0119	Yes
94	EPRS	6620	0.048	-0.0125	Yes
95	GEMIN5	6682	0.047	-0.0122	Yes
96	PAIP2	6715	0.046	-0.0103	Yes
97	NAP1L4	6743	0.045	-0.0081	Yes
98	NCOA6	6772	0.044	-0.0060	Yes
99	PAIP2B	6782	0.044	-0.0028	Yes
100	SKAP2	6791	0.044	0.0004	Yes
101	ZFYVE9	6810	0.044	0.0031	Yes
102	MED24	6944	0.041	-0.0005	Yes
103	CAPZA2	7017	0.039	-0.0008	Yes
104	SF3B3	7071	0.038	-0.0000	Yes
105	SLC7A6	7086	0.038	0.0029	Yes
106	EIF1AX	7318	0.033	-0.0061	Yes
107	NDUFS8	7329	0.032	-0.0030	Yes
108	NAP1L3	7368	0.032	-0.0014	Yes
109	EIF3D	7433	0.030	-0.0012	Yes
110	PICALM	7440	0.030	0.0021	Yes
111	SF3A1	7470	0.029	0.0042	Yes
112	NUP205	7472	0.029	0.0078	Yes
113	FAS	7473	0.029	0.0114	Yes
114	GTF3C4	7516	0.029	0.0128	Yes
115	HCFC1	7518	0.028	0.0164	Yes
116	SNAPC5	7521	0.028	0.0199	Yes
117	AMFR	7542	0.028	0.0225	Yes
118	EIF4H	7553	0.028	0.0256	Yes
119	COX18	7645	0.026	0.0243	Yes
120	SNRPD2	7694	0.025	0.0253	Yes
121	SMAD4	7713	0.025	0.0280	Yes
122	USP39	7721	0.024	0.0312	Yes
123	FANCC	7749	0.024	0.0334	Yes
124	GTF2F2	7812	0.023	0.0337	Yes
125	HMGB1	7903	0.021	0.0324	Yes
126	SET	7928	0.021	0.0348	Yes
127	SH3BGR	7958	0.020	0.0369	Yes
128	MED4	7975	0.020	0.0396	Yes
129	GTF2F1	7993	0.019	0.0424	Yes
130	MED30	8010	0.019	0.0451	Yes
131	DARS	8020	0.019	0.0483	Yes
132	SRSF6	8044	0.018	0.0507	Yes
133	OXA1L	8075	0.018	0.0527	Yes
134	VWF	8116	0.017	0.0542	Yes
135	LPXN	8212	0.015	0.0527	Yes
136	PPIH	8284	0.013	0.0524	Yes
137	ATXN2	8501	0.009	0.0443	Yes
138	PBX1	8512	0.009	0.0474	Yes
139	RPS14	8551	0.008	0.0490	Yes
140	EIF2S3	8596	0.007	0.0503	Yes
141	SFSWAP	8614	0.007	0.0530	Yes
142	PAIP1	8636	0.006	0.0555	Yes
143	NFS1	8676	0.005	0.0570	Yes
144	HPRT1	8699	0.005	0.0595	Yes
145	MNAT1	8754	0.004	0.0602	Yes
146	NAP1L1	8779	0.004	0.0625	Yes
147	CHAF1B	8796	0.003	0.0653	Yes
148	PEX13	8802	0.003	0.0687	Yes
149	PTRF	8804	0.003	0.0723	Yes
150	SURF1	9005	-0.001	0.0650	Yes
151	TXNL4A	9053	-0.002	0.0661	Yes
152	PRPF31	9084	-0.003	0.0681	Yes
153	TAF5	9109	-0.003	0.0705	Yes
154	MIS12	9144	-0.004	0.0723	Yes
155	TCAP	9156	-0.004	0.0753	Yes
156	GTF2I	9178	-0.005	0.0778	Yes
157	RPS3A	9194	-0.005	0.0806	Yes
158	EIF3B	9220	-0.005	0.0829	Yes
159	GPX3	9292	-0.007	0.0827	Yes
160	EIF2B5	9324	-0.008	0.0847	Yes
161	SRPK2	9491	-0.010	0.0793	Yes
162	NAP1L2	9503	-0.011	0.0823	Yes
163	PARD6B	9507	-0.011	0.0858	Yes
164	PML	9601	-0.013	0.0844	Yes
165	TUBGCP2	9894	-0.019	0.0721	Yes
166	PTK2B	9958	-0.020	0.0724	Yes
167	CELF1	9975	-0.020	0.0751	Yes
168	DDX20	9995	-0.020	0.0778	Yes
169	PICK1	10017	-0.021	0.0803	Yes
170	CAPZA1	10025	-0.021	0.0835	Yes
171	EIF5	10049	-0.021	0.0859	Yes
172	STOM	10051	-0.021	0.0895	Yes
173	EIF3G	10055	-0.021	0.0930	Yes
174	NDUFS4	10092	-0.022	0.0947	Yes
175	ATPIF1	10100	-0.022	0.0980	Yes
176	EIF2B4	10302	-0.026	0.0907	Yes
177	STK16	10335	-0.027	0.0926	Yes
178	CDK9	10347	-0.027	0.0956	Yes
179	FAF1	10352	-0.027	0.0991	Yes
180	SF3A2	10461	-0.029	0.0968	Yes
181	EIF1	10535	-0.031	0.0965	Yes
182	VCL	10548	-0.031	0.0995	Yes
183	NDUFS7	10561	-0.031	0.1025	Yes
184	EID2	10574	-0.031	0.1055	Yes
185	RANBP9	10620	-0.032	0.1067	Yes
186	DAG1	10699	-0.034	0.1061	Yes
187	MTIF3	10852	-0.038	0.1014	Yes
188	BRF1	10895	-0.039	0.1028	Yes
189	OCLN	10939	-0.040	0.1041	Yes
190	EIF2B3	11023	-0.042	0.1032	Yes
191	MDM2	11200	-0.046	0.0973	Yes
192	SRSF9	11254	-0.048	0.0981	Yes
193	GTF2E1	11263	-0.048	0.1013	Yes
194	TSPAN4	11302	-0.049	0.1029	Yes
195	EIF3I	11335	-0.050	0.1048	Yes
196	ALDH5A1	11404	-0.051	0.1047	Yes
197	TBP	11410	-0.051	0.1081	Yes
198	GTF2E2	11451	-0.052	0.1096	Yes
199	MED26	11457	-0.052	0.1129	Yes
200	ADRM1	11586	-0.055	0.1096	Yes
201	MED27	11644	-0.057	0.1102	Yes
202	SF3A3	11695	-0.058	0.1111	Yes
203	MED7	11718	-0.059	0.1135	Yes
204	EIF5A	11739	-0.059	0.1161	Yes
205	LLGL1	11789	-0.060	0.1171	Yes
206	TAPBP	11888	-0.063	0.1154	Yes
207	PBX3	11890	-0.063	0.1190	Yes
208	EIF2B1	11899	-0.063	0.1222	Yes
209	MAZ	12027	-0.066	0.1189	Yes
210	KPNA3	12180	-0.069	0.1143	Yes
211	APC2	12256	-0.071	0.1139	Yes
212	MED16	12309	-0.072	0.1147	Yes
213	NDUFS5	12413	-0.075	0.1127	Yes
214	NUBP1	12551	-0.079	0.1089	Yes
215	CDC42	12574	-0.080	0.1114	Yes
216	SNRPD1	12582	-0.080	0.1146	Yes
217	IL2RB	12674	-0.083	0.1133	Yes
218	ZW10	12681	-0.083	0.1166	Yes
219	MYH11	12721	-0.084	0.1182	Yes
220	WASL	12742	-0.085	0.1207	Yes
221	PEX14	12932	-0.090	0.1141	Yes
222	EIF2B2	12953	-0.090	0.1166	Yes
223	PARD3	13008	-0.092	0.1173	Yes
224	CDK7	13042	-0.093	0.1192	Yes
225	ADRB2	13083	-0.094	0.1207	Yes
226	HFE	13164	-0.097	0.1200	Yes
227	CCDC88C	13185	-0.098	0.1225	Yes
228	EIF3J	13216	-0.099	0.1245	Yes
229	SMAD3	13263	-0.101	0.1257	Yes
230	LIN7A	13357	-0.104	0.1243	Yes
231	MTIF2	13375	-0.104	0.1270	Yes
232	MAP3K11	13393	-0.105	0.1297	Yes
233	GEMIN2	13581	-0.111	0.1232	Yes
234	SLC7A7	13593	-0.111	0.1262	Yes
235	SRSF12	13608	-0.112	0.1291	Yes
236	NLRP3	13686	-0.115	0.1286	Yes
237	CD74	13713	-0.116	0.1308	Yes
238	BCS1L	13781	-0.119	0.1308	Yes
239	REPS2	13889	-0.123	0.1286	Yes
240	SRC	13892	-0.123	0.1322	Yes
241	FANCA	13979	-0.127	0.1311	No
242	TRAF2	14160	-0.136	0.1250	No
243	CD40	14170	-0.137	0.1281	No
244	SEPT9	14444	-0.151	0.1169	No
245	EIF2AK4	14480	-0.152	0.1187	No
246	DLG4	14501	-0.154	0.1212	No
247	HSPB1	14507	-0.154	0.1246	No
248	BAX	14600	-0.158	0.1232	No
249	ASF1A	14646	-0.161	0.1244	No
250	COX10	14673	-0.162	0.1267	No
251	CDA	14799	-0.171	0.1235	No
252	PTCH2	14806	-0.172	0.1268	No
253	SLC9A3R2	14873	-0.176	0.1269	No
254	WAS	15089	-0.192	0.1188	No
255	CDC42EP2	15115	-0.194	0.1211	No
256	TP53	15141	-0.196	0.1234	No
257	AKR1C1	15413	-0.219	0.1123	No
258	HMGA1	15715	-0.251	0.0995	No
259	IRAK1	15778	-0.260	0.0998	No
260	CD3E	16300	-0.334	0.0751	No
261	MATN1	16335	-0.340	0.0769	No
262	TPPP	16378	-0.349	0.0782	No
263	TGM3	16506	-0.378	0.0750	No
264	TRPV5	16890	-0.478	0.0577	No
265	UPK1A	16932	-0.486	0.0592	No
266	APOE	17052	-0.519	0.0563	No
267	SLC9A3R1	17098	-0.535	0.0575	No
268	SYT1	17164	-0.563	0.0576	No
269	SCUBE1	17290	-0.623	0.0545	No
270	E2F2	17387	-0.674	0.0529	No
271	PBX4	17422	-0.691	0.0547	No
272	MUC20	17755	-0.926	0.0403	No
273	BOLL	17843	-0.990	0.0392	No
274	DAZL	18049	-1.182	0.0317	No